在终端中执行samtools：“未找到命令”，但已安装
我已经安装了samtools，并且以前在计算机上使用过它...
如何最有效地从NarrowPeakBED6 + 4格式的文件中检索数据？
我正在从事一个生物信息学项目，该项目涉及很大的&l...
从Fasta文件中提取映射的配对末端读
我有10个样本，可以得到配对的末端读数： <pre&g...
使用bowtie2为循环for循环应用文件限制
你好，我只想对一组文件应用循环，而不是对我的所有...
如何使用 varscan 三重奏调用者管理 samtools mileup？
我已经看到如下使用 varscan 管道 samtools <pre...
更高的差距惩罚会增加 bwa 中的读取总数
我正在使用 BWA MEM 将双端 fastq 文件与两个参考序...
python中使用subprocess.run()运行samtools的问题
我正在使用 subprocesss.run() 在 python 中运行 sa...
估计读取中碱基子集的参考编辑距离bam 文件
我对 bam/sam 文件很陌生，但我想估计到参考 (NM) 的...
MarkDuplicates Picard
我使用 Picard 仅标记我阅读了 MarkDuplicates 手册...
多个输出到单个列表输入 - 在 Nextflow
我正在尝试将 <em>x</em> 个通过一次执...
我是 Linux 新手，我正在尝试激活“模块加载 python2 samtools rseqc”，但我遇到了 Lmod 版本问题
我一直收到这个错误； <pre><code>ERRO...
为什么 vcf2fq 生成的共识序列即使在它们占主导地位时也会错过插入缺失？怎么修？
在比对序列读数并转换为 BAM 后，我可以看到 9 碱基...
程序在完成时在 VM 上崩溃
我在具有 8 个 CPU 的谷歌 VM 上运行 <code>s...
Snakemake Conda 环境似乎没有激活，尽管它说它是
我正在使用 <code>--use-conda</code> ...