snakemake中的命令行
我要使用以下命令行在文件夹中创建BAM文件列表： &l...
运行多个snakemake规则
我想使用snakemake一个接一个地运行多个规则。但是，...
从Fasta文件中提取映射的配对末端读
我有10个样本，可以得到配对的末端读数： <pre&g...
尝试在没有来自 bam() 输出的随机影响的情况下进行预测时出错
我有一个数据集，我想在 mgcv 包中与 bam() 配合使用...
估计读取中碱基子集的参考编辑距离bam 文件
我对 bam/sam 文件很陌生，但我想估计到参考 (NM) 的...
多个输出到单个列表输入 - 在 Nextflow
我正在尝试将 <em>x</em> 个通过一次执...
对 bam 文件进行子采样以仅包含长度大于 X 的读取
我有多个 .bam 文件（与 bwa 对齐），我想生成一个子...
R mgcv：bam自相关缺失值
我有一个实验的数据。参与者对一些项目做出了回应，...
使用snakemake中的动态输出来分割BAM文件
我正在尝试使用 Snakemake 规则来拆分和处理大 bam ...
使用 Python 从 BAM 文件和 vcf 文件中提取具有变异位置的读取和配对PYSAM 和 PYSAM，也可以使用 bamnostics
我正在使用 Python 并使用 PYSAM 和 PyVCF 库进行数...
如何使用 pysam.view() 将 SAM 转换为 BAM
我想使用 <a href="https://pysam.readthedo...
是什么限制了我的“Parallel.For”应用程序？
使用 VS2019, C#.net 5.0 我写了一个应用程序，计算...
Bam 文件的排序运行很慢
我正在尝试使用 samtools 排序功能对一个不大的 bam...
为什么 grep 后特定的“samtools 视图”行被破坏了？
我想提取 readname 列表，其中一个是唯一映射的，另...