使用--profile slurm
我正在使用snakemake创建一个管道来调用纳米孔测序数...
Snakemake：命名方案不一致的MissingInputException
我正在尝试使用带有Minimap2的Porechop处理MinION c...
在多个样本上循环执行蛇形制作规则
我已经开始使用snakemake来构建工作流，以在样本列表...
用snakemake更改目录名和fastq文件名
我想更改文件夹名称和读取文件的名称。从这里我发现...
将环境conda中的shell命令与python脚本混合
我想在环境conda中将shell命令与任何Python脚本混合...
Snakemake-检查点结束后继续处理单个文件
当在检查点之后继续处理单独的文件时，我似乎无法理...
在Snakemake管道中添加自动QC，以在管道步骤的中间过滤出质量较差的样品
我的问题与此类似：<a href="https://stacko...
snakemake作业提交的顺序方式
我写了一个蛇形管道来执行sortmeRNA 4.2.0版本。管道...
在Snakemake中合并多个通配符
<pre><code>├── DIR1 │ ├── s...
许多Trimmomatic修整参数在Snakemake包装器中不起作用
以前，我的<code>Trimmomatic</code> s...
将环境conda中的shell命令与snakemake工具中的python脚本混合
我想在环境conda中将shell命令与任何Python脚本混合...
输入与输出：作业成功完成，但是缺少一些输出文件
我认为我的管道失败了，因为预期的全部规则输出与实...
如何在Snakemake中使用奇异和conda包装器 Snakefile config.yaml samples.txt 使用shell: 代替wrapper: 可重复性 更新3：绑定挂载
<strong> TLDR </strong>我遇到以下错...
如何在蛇形配置文件Yaml文件中定义key = var参数
snakemake的某些参数遵循key = value模式。我想将它...