我想用
pythonic方法替换字符串中的一些字符.
A -> T C -> G G -> C T -> A
例:
AAATCGATTGAT
将转变为
TTTAGCTAACTA
我做了什么:
def swap(string): string = re.sub('A','aux',string) string = re.sub('T','A',string) string = re.sub('aux','T',string) string = re.sub('C',string) string = re.sub('G','C','G',string) return string
它工作得很好,但我正在寻找一种更加pythonic的方法来实现这一目标.
解决方法
使用带有理解和str.join的字典:
translateDict = { "A" : "T","C" : "G","G" : "C","T" : "A" } s1 = "AAATCGATTGAT" reconstructed = "".join(translateDict.get(s,s) for s in s1)
注意使用dict.get
;如果字母不在字典中,我们只是按原样放过它.
正如@ bravosierra99建议的那样,你也可以简单地使用str.translate
:
reconstructed = s1.translate(string.maketrans(translateDict))