python – 使用h5py压缩现有文件

我目前正在开发一个关于压缩HDF5数据集的项目,最近开始使用h5py.我遵循基本教程,能够在创建文件时打开,创建和压缩文件.但是,在压缩现有文件时这是不成功的(这是我工作的目的).

我尝试使用’r’打开文件,然后压缩分块数据集,但文件大小保持不变.

有关使用什么命令的建议或我是否以错误的方式处理事情？

解决方法

压缩在h5py中非常容易使用.查看Wiki HowTo和 Compression指南.
基本上,它会是这样的：

ds = myfile.create_dataset('ds',shape,dtype,compression='lzf')

如何选择块大小以优化文件大小/访问权限也存在一些问题,请参阅我链接到的压缩指南.

我不记得默认情况下打开哪个压缩(如果有).