XSLT 3.0封装式来源PROV

编程问答 2022-06-22

问题描述

我有输入XML（注意：有相邻的ICD-9-CM元素。有重复的codeSystemName | code）

<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>

<ClinicalDocument xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance"
    xsi:schemaLocation="urn:hl7-org:v3 ../../C-CDA%20rules/infrastructure/cda/CDA_SDTC.xsd"
    xmlns="urn:hl7-org:v3" xmlns:voc="urn:hl7-org:v3/voc">
    <realmCode code="US"/>
    <typeId root="2.16.840.1.113883.1.3" extension="POCD_HD000040"/>
    <templateId root="2.16.840.1.113883.10.20.22.1.1"/>
……………

    <translation code="J45" codeSystem="2.16.840.1.113883.6.90"
        displayName="Asthma" codeSystemName="ICD-10-CM"/>
    <translation code="493.92" codeSystem="2.16.840.1.113883.6.103"
        displayName="Asthma,unspecified type,with (acute) exacerbation" codeSystemName="ICD-9-CM"/>
……………..
<translation code="J45" codeSystem="2.16.840.1.113883.6.90"
    displayName="Asthma" codeSystemName="ICD-10-CM"/>
<translation code="493.92" codeSystem="2.16.840.1.113883.6.103"
    displayName="Asthma,with (acute) exacerbation" codeSystemName="ICD-9-CM"/>
…………..

<translation code="G0121" codeSystem="2.16.840.1.113883.6.13"
    displayName="Colon ca scrn not hi rsk ind" codeSystemName="HCPCS"/>
<translation code="Z12.11" codeSystem="2.16.840.1.113883.6.90"
    displayName="Encounter for screening for malignant neoplasm of colon" codeSystemName="ICD-10-CM"/>
<translation code="45.23" codeSystem="2.16.840.1.113883.6.103"
    displayName="Colonoscopy" codeSystemName="ICD-9-CM"/>
<translation code="174184006" codeSystem="2.16.840.1.113883.6.96"
    displayName="Diagnostic endoscopic examination on colon" codeSystemName="SNOMED-CT"/>
...........

我希望信封Provenance之间的元素

<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>

AND 

<ClinicalDocument xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance"
    xsi:schemaLocation="urn:hl7-org:v3 ../../C-CDA%20rules/infrastructure/cda/CDA_SDTC.xsd"
    xmlns="urn:hl7-org:v3" xmlns:voc="urn:hl7-org:v3/voc">

Provenance的构造是

<Provenance xmlns="http://hl7.org/fhir">
  <id value="Patient/codeSystem_history/v1"/>
  <derivation value="Transformation: ICD-10-CM,ICD-10-PCS,SNOMED-CT,HCPCS"/>
  <lastTransformed value="2020-09-09"/>
  <translation>
        <coding>
            <system value="http://hl7.org/fhir/sid/icd-10"/>
            <code value="H40.11X0"/>
            <display value="Primary open-angle glaucoma,stage unspecified"/>
        </coding>
        <coding>
            <system value="http://hl7.org/fhir/sid/icd-10"/>
            <code value="I25.1"/>
            <display value="Atherosclerotic heart disease of native coronary artery"/>
        </coding>
        <coding>
            <system value="HCPCS"/>
            <code value="G0121"/>
            <display value="Colon ca scrn not hi rsk ind"/>
        </coding>
        <coding>
        <!-- Procedure Outcome(SNOMED CT): http://snomed.info/sct-->
            <system value="SNOMED-CT"/>
            <code value="176259004"/>
            <display value="Radical prostatectomy - unspecified excision of pelvic nodes"/>
        </coding>       
  </translation>
        <coding>
…………………………
        </coding>

…………………………

</Provenance>

Provenance的逻辑是

  1. 标识所有 unique codeSystemName属性，其值分别为ICD-10-CM，ICD-10-PCS，HCPCS和{{1 }}中的SNOMED-CT元素。

  2. 转换并创建属性| translation @ translation中的元素：

  • Provenance是codeSystemName： ICD-10-***
  • <system value="http://hl7.org/fhir/sid/icd-10"/>是codeSystemName： HCPCS
  • <system value="HCPCS"/>是codeSystemName： SNOMED-CT

在<system value=" SNOMED-CT "/>之后是相应的system（code）和/translation/@code（display）元素。

我的代码：

/translation/@displayName

但是渲染效果不是我期望的

  • 首先，会产生重复项，并且所有<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?> <xsl:stylesheet version="3.0" xmlns:xsl="http://www.w3.org/1999/XSL/Transform" xmlns:n1="urn:hl7-org:v3" exclude-result-prefixes="#all"> <xsl:output indent="yes" method="xml" encoding="utf-8"/> <xsl:param name="date" select="current-dateTime()"/> <xsl:param name="ICD-10" select="'http://hl7.org/fhir/sid/icd-10'"/> <xsl:param name="SNOMED-CT" select="'SNOMED-CT'"/> <xsl:param name="HCPCS" select="'HCPCS'"/> <!-- <xsl:key name="code-system-name" match="n1:translation" use="translate(normalize-space(@codeSystemName),' &#x9;&#xa;&#xD;.;','')"/>--> <!-- <xsl:key name="code-system-name" match="n1:translation" use="@codeSystemName"/>--> <xsl:template match="/"> <Provenance xmlns="http://hl7.org/fhir"> <id value="Patient/codeSystem_history/v1"/> <derivation value="Transformation: ICD-10-CM,HCPCS"/> <lastTransformed> <xsl:attribute name="value" select="$date"/> </lastTransformed> <translation> <xsl:call-template name="coding-template" /> </translation> </Provenance> </xsl:template> <xsl:template name="coding-template" > <xsl:for-each select="//n1:translation"> <!-- <xsl:for-each-group select="//n1:translation" group-by="@codeSystemName">--> <!-- group-adjacent="if (self::p[@codeSystemName='ICD-10-CM']) then $ICD-10 else if (self::p[@codeSystemName ='SNOMED-CT']) then $SNOMED-CT else $HCPCS ">--> <coding xmlns="http://hl7.org/fhir"> <xsl:element name="system"> <xsl:attribute name="value"> <xsl:choose> <!-- <xsl:when test="key('code-system-name','ICD-10-CM')">--> <xsl:when test="contains(@codeSystemName,'ICD-10')"> <xsl:value-of select="$ICD-10"/> </xsl:when> <xsl:when test="contains(@codeSystemName,'SNOMED-CT')"> <xsl:value-of select="$SNOMED-CT"/> </xsl:when> <xsl:when test="contains(@codeSystemName,'HCPCS')"> <xsl:value-of select="$HCPCS"/> </xsl:when> </xsl:choose> </xsl:attribute> </xsl:element> <xsl:element name="code"> <xsl:attribute name="value"><xsl:value-of select="@code"/></xsl:attribute> </xsl:element> <xsl:element name="display"> <xsl:attribute name="value"><xsl:value-of select="@displayName"/></xsl:attribute> </xsl:element> </coding> </xsl:for-each> <!--</xsl:for-each-group>--> </xsl:template> 都会被无意中提取（ICD-9-CM）。
<system value=""/>
  • 第二，原始文档未保留。

解决方法

听起来好像您想执行以下操作：

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<xsl:stylesheet xmlns:xsl="http://www.w3.org/1999/XSL/Transform"
    xmlns:xs="http://www.w3.org/2001/XMLSchema"
    xpath-default-namespace="urn:hl7-org:v3"
    exclude-result-prefixes="#all"
    xmlns="http://hl7.org/fhir"
    version="3.0">
    
  <xsl:param name="needed-codes" as="xs:string*"
    select="'ICD-10-CM','ICD-10-PCS','HCPCS','SNOMED-CT'"/>

  <xsl:mode on-no-match="shallow-skip"/>

  <xsl:output method="xml" indent="yes"/>

  <xsl:template match="/*">
     <Provenance>
        <id value="Patient/codeSystem_history/v1"/>
        <derivation value="Transformation: {$needed-codes}"/>
        <translatation>
            <xsl:for-each-group select="//translation[@codeSystemName = $needed-codes]"
              composite="yes" group-by="@code,@codeSystem">
                <coding>
                    <xsl:apply-templates select="@codeSystemName,@code,@displayName"/>
                </coding>
            </xsl:for-each-group>
        </translatation> 
     </Provenance>
     <xsl:copy-of select="."/>
  </xsl:template>
  
  <xsl:template match="translation[starts-with(@codeSystemName,'ICD-10-')]/@codeSystemName">
      <system value="http://hl7.org/fhir/sid/icd-10"/>
  </xsl:template>
  
  <xsl:template match="translation[@codeSystemName = 'HCPCS']/@codeSystemName">
      <system value="HCPCS"/>
  </xsl:template>
  
  <xsl:template match="translation[@codeSystemName = 'SNOMED-CT']/@codeSystemName">
      <system value="SNOMED-CT"/>
  </xsl:template>
  
  <xsl:template match="@code">
      <code value="{.}"/>
  </xsl:template>
  
  <xsl:template match="@displayName">
      <display value="{.}"/>
  </xsl:template>
  
</xsl:stylesheet>

我不太确定自己是否使用了正确的选择和正确的分组键（因为我不知道输入格式，而且这个问题不能清楚地描述输入/输出片段是否匹配），但至少可以输入数据的一些分组和转换。

我不明白“未保留原始文档”指的是什么，不清楚在所需的输出样本中您在何处进行描述。

xmlxmlxmlxmlxmlxmlxmlxsltxsltxslt-3.0