问题描述
我是 R 新手。我正在使用“clogitL1”为具有 1021 个自变量（代谢物）的匹配病例对照研究运行正则化条件逻辑回归。我无法提取回归系数。我试过 summary(x)、coef(x)、coefficient(x)、x$beta - 它们都不起作用。我能够运行它，如果我使用“cv.clogitL1”来跟踪它，我可以提取交叉验证的估计系数，但不能提取原始模型的估计系数。这是我的一些代码：
strata=sort(data.Meta$MATCHED_NEW)
condlog <- clogitL1(y=data.Meta$BCR,x=data.Meta$ln_Metab[,data.features ],strata,numLambda=100,minLambdaratio=0.000001,alpha = 1.0)
“strata”是一个向量，表示案例和控制的配对。 "data.Meta$BCR" 是一个向量指示案例或控制状态 “data.Meta$ln_Metab”是一个矩阵，观察值作为行，代谢物水平作为列 “data.feature”是一个向量，表示哪些代谢物通过了几个降维过滤器。
感谢任何建议。
解决方法
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