由于 getNodeSet {XML} 错误 biomaRt getBM 无法工作

问题描述

我在 r 中运行以下代码但它不起作用。 getBM 似乎不适用于任何参数。我做错了什么吗？

ibrary(biomart)

ensembl <- useEnsembl(biomart = "genes")
ensembl <- useEnsembl(biomart = "ensembl",dataset = "hsapiens_gene_ensembl",mirror = "useast")
affyids <- c("202763_at","209310_s_at","207500_at")
getBM(attributes = c('affy_hg_u133_plus_2','entrezgene_id'),filters = 'affy_hg_u133_plus_2',values = affyids,mart = ensembl)

我得到的错误是 Error in getNodeSet(html,path = "//div[@class='plain-Box float-right archive-Box']")[[1]] : subscript out of bounds 我在 r 版本 3.6.3 和 4.1 中都试过这个

解决方法

根据 https://www.ensembl.org/info/，Ensembl 暂时不可用。