clustalx序列比对步骤?clustalx使用方法教程

clustalx序列比对步骤?clustalx是一款简单高效的序列比对分析软件,用于多重比对不同物种的序列,以确定该序列与其它序列间的同源性大小,那具体要怎么使用呢?一起来看下序列比对的详细步骤教程吧。

clustalx序列比对步骤?

1、打开ClustalX,依次在菜单栏选择“File”-“Load Sequences”导入我们的目的序列(fas格式)。

2、然后进行完全比对,依次选择“Alignment”-“Do Complete Alignment”

3、选择保存路径,点击“OK”。一般生成两个文件,分别是*.aln和*.dnd文件,可以用“记事本”打开。

4、由于*.aln和*.dnd这两个文件的可读性不是太好,因此我们需要将文件保存成*.msf文件绘制多重比对效果图。依次点击“File”-“Save Sequences as”,然后选择“GCG/MSF format”,将多重序列比对结果保存成msf文件

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