问题描述
软件：FIJI，FIJI Is Just ImageJ
1. 加载图像
将RGB图像，输入至ImageJ，同时，生成图像的备份，避免修改原图：
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Option + Shift + D：Duplicate生成图像，默认为 原图像名称-1 ； -
Command + Shift + D：Duplicate生成图像，可选图像名，默认为 原图像名称-1 ；
| Raw | Duplicate |
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2. 获取灰度通道
转换颜色空间 RGB -> Lab，分离通道，转换为8-bit图像
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转换颜色空间：
Image -> Type -> Lab Stack -
提取通道：
Image -> Color -> Split Channels -
转换为 8 Bit 图像：
Image -> Type -> 8-bit
图像：
| Lab | 通道1 | 8 -bit |
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3. 平衡、阈值、分水岭操作
将图像平滑，再根据阈值提取Mask，再进行分水岭操作，拆分粘连区域。注意，需要提前修改 BinaryOptions的设置 和 Threshold的设置：
- 需要提前设置BinaryOptions，否则报错：
Process -> Binary -> Options，勾选Black background - 平滑操作：
Process -> Smooth (Command + Shift + S) - 阈值操作：
Image -> Adjust -> Threshold (Command + Shift + T) - 分水岭操作：
Process -> Binary -> Watershed，深入研究：Plugins -> BioVoxxel -> Watershed Irregular Features
BinaryOptions报错信息：
"Black background" not set in Process>Binary>Options; inverting LUT
| Smooth | Threshold | Threshold - Apply | Watershed |
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参数设置：
| BinaryOptions | Threshold |
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4. 分析强度
分析粒子，需要修改 Analyze Particles 的配置 和 Set Measurements 的配置：
- 分析粒子：
Analyze -> Analyze Particles - 修改Measurements的设置：
Analyze -> Set Measurements
| Analyze Particles | Set Measurements |
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输出3个窗口：Results、Summary、ROI Manager
| Results | Summary | ROI Manager |
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ROI可以迁移到任意图像，Mask、GRAY、RGB都可以，选择不同图像，点击 ROI Manager 的 Show All 和 Labels，即可。
| Mask | GRAY | RGB |
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统计强度：
- 修改Measurements的设置：
Analyze -> Set Measurements - 清空Results结果：
右键 -> Clear Results - 选择灰度图像，再点击 ROI Manager 的 Measure，进行测量
- Results的值发生变动，点击 Results -> Summary，统计汇总值，增加Mean、SD、Min、Max等4行
| Results | Summary |
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解决方法
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