Python MySQLdb executemany

我正在使用Python及其MySQLdb模块将一些测量数据导入Mysql数据库.我们拥有的数据量非常高(目前大约有250 MB的csv文件,还有很多其他文件).

目前我使用cursor.execute(…)导入一些元数据.这不是问题,因为这些只有少数条目.

问题是,当我尝试使用cursor.executemany()导入更大量的实际测量数据时,MySQLdb提出了一个问题.

TypeError: not all arguments converted during string formatting

我目前的代码是

def __insert_values(self,values):
    cursor = self.connection.cursor()
    cursor.executemany("""
        insert into values (ensg,value,sampleid)
        values (%s,%s,%s)""",values)
    cursor.close()

其中values是一个元组列表,每个元组包含三个字符串.任何想法可能有什么问题吗?

编辑:

这些值由.生成

yield (prefix + row['id'],row['value'],sample_id)

然后一次读入一个列表,其中row是和来自csv.DictReader的迭代器.

最佳答案
在回顾展中,这是一个非常愚蠢但很难发现的错误.值是sql中的关键字,因此表名值需要围绕它的引号.

def __insert_values(self,values):
    cursor = self.connection.cursor()
    cursor.executemany("""
        insert into `values` (ensg,values)
    cursor.close()

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