在Spark中加载镶木地板文件后出现奇怪的数据偏斜

问题描述

我正在使用PySpark(约10个执行程序,每个执行程序有4-5个内核)以拼合形式从云存储中读取一些数据到Spark DataFrame中。 spark.sql.files.maxPartitionBytes是在加载之前设置的,因此我可以控制每个分区的大小,然后控制我可以获取的分区数。加载数据后,我将Spark函数/ UDF应用于数据。因此,不应发生洗牌(join和groupby)。我期望每个分区在加载后具有相对相等的分区大小,但现实情况是加载的数据非常不对称。

在YARN中查看时,最小,25%,中位数和75%的分区大小均为21 B(基本上为空分区),而最大分区大小为100 MB(已加载所有行)。

我现在要解决此歪斜的方法是执行df.repartition()以在加载后立即均匀分布它,并且效果很好。但这又引入了另一种不理想的数据改组方法。

所以问题是,为什么默认情况下分区在加载后是如此偏斜?有没有办法让我以相对均匀的分区大小加载它们并跳过该df.repartition()步骤?

谢谢!

解决方法

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