问题描述
我有一个要写入文件的元组列表的列表,以便可以被另一个文件读入以进行后处理。如果它有助于其图中的循环列表,则每个循环循环本身就是一个元组列表。我将此列表称为cycle_basis
。
目前这是我的写法:
df = DataFrame()
df.Path = cycle_basis
df.Size = cycle_size
CSV.write("cycle_basis.csv",df)
cycle_size只是一个整数,代表每个循环中的边数。我可以看到它以如下方式存储在CSV中(出于这篇文章的缘故,它运行在一个超小的图上,通常该文件要长得多):
Path,Size
"[(1,3),(2,(1,2)]",3
"[(4,5),(3,4),5
我尝试将每个字符串转换为原始字符串,如下所示:convert(Array{Tuple{Int64,Int64},1},cycle.Path[1])
,但这只是给了我以下错误:
ERROR: MethodError: Cannot `convert` an object of type String to an object of type Array{Tuple{Int64,1}
Closest candidates are:
convert(::Type{Array{S,N}},::PooledArrays.PooledArray{T,R,N,RA} where RA) where {S,T,N} at /home/charper/.julia/packages/PooledArrays/yiLq3/src/PooledArrays.jl:294
convert(::Type{T},::AbstractArray) where T<:Array at array.jl:533
convert(::Type{T},::T) where T<:AbstractArray at abstractarray.jl:14
...
Stacktrace:
[1] top-level scope at none:0
我用parse()尝试了同样的操作,并得到了类似的错误。
解决方法
我不建议将CSV存储用于此类数据。可能最简单的方法是JSONTables.jl:
julia> df = DataFrame(a=[1,2],b=[[(1,2),(3,4)],[(5,6),(7,8)]])
2×2 DataFrame
│ Row │ a │ b │
│ │ Int64 │ Array… │
├─────┼───────┼──────────────────┤
│ 1 │ 1 │ [(1,4)] │
│ 2 │ 2 │ [(5,8)] │
julia> s = arraytable(df)
"[{\"a\":1,\"b\":[[1,[3,4]]},{\"a\":2,\"b\":[[5,6],[7,8]]}]"
julia> DataFrame(jsontable(s))
2×2 DataFrame
│ Row │ a │ b │
│ │ Int64 │ Array… │
├─────┼───────┼──────────────────┤
│ 1 │ 1 │ [[1,4]] │
│ 2 │ 2 │ [[5,8]] │
julia> DataFrame(jsontable(objecttable(df))) # objecttable gives you a different layout of data
2×2 DataFrame
│ Row │ a │ b │
│ │ Int64 │ Array… │
├─────┼───────┼──────────────────┤
│ 1 │ 1 │ [[1,8]] │
我在这里展示了如何将其存储在String
中并读回,但是您可以改用IO
。
回读不会恢复元组,但会恢复结构。
现在-这只是一个选择。本教程中对DataFrames.jl的不同加载/保存选项进行了比较:https://github.com/bkamins/Julia-DataFrames-Tutorial/blob/master/04_loadsave.ipynb。
现在可以使用CSV了:
julia> CSV.write("tmp.csv",df)
"tmp.csv"
julia> df2 = CSV.File("tmp.csv") |> DataFrame
2×2 DataFrame
│ Row │ a │ b │
│ │ Int64 │ String │
├─────┼───────┼──────────────────┤
│ 1 │ 1 │ [(1,8)] │
julia> df2.b = eval.(Meta.parse.(df2.b))
2-element Array{Array{Tuple{Int64,Int64},1},1}:
[(1,4)]
[(5,8)]
julia> df2
2×2 DataFrame
│ Row │ a │ b │
│ │ Int64 │ Array… │
├─────┼───────┼──────────────────┤
│ 1 │ 1 │ [(1,8)] │
但这不是安全的方法。在eval
中,可以注入任何不安全的代码来执行。