如何使网纹识别我的miniconda python和我的环境？

编程问答 2022-10-31

问题描述

我对python来说还比较陌生，我想以“正确”的方式安装它（当然，有很多），可以通过网状结构在本机和R中使用。

这是我到目前为止所做的：

  • 我从头开始重新安装了MacOS Catalina，并通过自制软件安装了Miniconda。
  • 通过miniconda，我已更新至python 3.8.5。
  • 然后，我在R中安装了网状结构（R版本4.0.2，RStudio版本1.3.1056）。当网状询问我是否要安装miniconda时，我拒绝了（因为它已经安装了。
  • 我在zsh终端中用python别名python3。

这是麻烦开始的地方。我不能（也不能）网状识别我的python安装，或者，如果我可以网状识别它的安装，我就不能识别它的python环境。

根据elsewhere的建议，我将RETIculaTE_PYTHON更改为/usr/local/bin/python3，这实际上与我的python安装之一匹配。现在我收到错误Error: Could not find a Python environment for /usr/local/bin/python3

我还尝试设置我的miniconda python的路径，该路径位于/usr/local/Caskroom/miniconda/base/中。或更具体地说，如type -a python python3中的/usr/local/Caskroom/miniconda/base/bin/python3中所获得。不幸的是，一旦我将网状目录更改为miniconda版本，出于我不了解的原因，type将不再返回/usr/local/Caskroom/miniconda/base/bin/python3。

现在运行type -a python python3时，收到以下输出：

python is an alias for python3
python is /usr/bin/python
python3 is /usr/local/bin/python3
python3 is /usr/local/bin/python3
python3 is /usr/bin/python3
python3 is /usr/local/bin/python3

我不知道我的miniconda安装发生了什么（运行conda --version时，我收到conda 4.8.3的情况似乎仍然可以正常工作）。

所以总结一下现状：

  • 从终端运行python可以正常工作（既可以交互又可以执行py文件）
  • 网状结构可以识别我在RETIculaTE_PYTHON中设置的路径
  • 我运行type -a python python3时不再显示我的迷你话机
  • 最重要的是：即使我使用reticulate::conda_create()在终端中创建了一个带有miniconda的环境，并在Rstudio中创建了另一个环境，网状结构也无法识别我的环境。

所以我的问题是，我怎么能成为网状的

  1. 识别我的迷你康达蟒蛇
  2. 认识到我使用conda创建的各种环境（R的内部和外部）

解决方法

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pythonrrreticulate