问题描述
我是Python的新手,所以我对基本的编程技能表示歉意,我知道我使用了太多的“循环”(来自Matlab,这使我失望了)。
我有数百万个点(时间步长,经度,纬度,pointID)和数百个不规则的不重叠多边形(vertex_long,vertex_lat,polygonID)。points and polygons format sample
我想知道每个点包含什么多边形。
我能够这样做:
from matplotlib import path
def inpolygon(lon_point,lat_point,lon_poly,lat_poly):
shape = lon_point.shape
lon_point = lon_point.reshape(-1)
lat_point = lat_point.reshape(-1)
lon_poly = lon_poly.values.reshape(-1)
lat_poly = lat_poly.values.reshape(-1)
points = [(lon_point[i],lat_point[i]) for i in range(lon_point.shape[0])]
polys = path.Path([(lon_poly[i],lat_poly[i]) for i in range(lon_poly.shape[0])])
return polys.contains_points(points).reshape(shape)
然后
import numpy as np
import pandas as pd
Areas_Lon = Areas.iloc[:,0]
Areas_Lat = Areas.iloc[:,1]
Areas_ID = Areas.iloc[:,2]
Unique_Areas = np.unique(Areas_ID)
Areas_true=np.zeros((Areas_ID.shape[0],Unique_Areas.shape[0]))
for i in range(Areas_ID.shape[0]):
for ii in range(Unique_Areas.shape[0]):
Areas_true[i,ii]=(Areas_ID[i]==Unique_Areas[ii])
Areas_Lon_Vertex=np.zeros(Unique_Areas.shape[0],dtype=object)
Areas_Lat_Vertex=np.zeros(Unique_Areas.shape[0],dtype=object)
for i in range(Unique_Areas.shape[0]):
Areas_Lon_Vertex[i]=(Areas_Lon[(Areas_true[:,i]==1)])
Areas_Lat_Vertex[i]=(Areas_Lat[(Areas_true[:,i]==1)])
import f_inpolygon as inpolygon
Areas_in=np.zeros((Unique_Areas.shape[0],Points.shape[0]))
for i in range (Unique_Areas.shape[0]):
for ii in range (PT.shape[0]):
Areas_in[i,ii]=(inpolygon.inpolygon(Points[ii,2],Points[ii,3],Areas_Lon_Vertex[i],Areas_Lat_Vertex[i]))
这样,最终结果Areas_in Areas_in format包含与多边形一样多的行,以及与点一样多的列,其中该点相对于多边形索引的行中的每一列均为true = 1(第一个给定的多边形ID ->第一行,依此类推。
代码可以正常工作,但是执行起来很慢。当我在规则网格中或点半径内定位点时,我成功地实现了KDtree,这极大地提高了速度,但是对于不规则的不重叠多边形,我无法做到相同或更快。
我已经看到了一些相关的问题,但不是问一个点是什么多边形,而是关于一个点是否在多边形内部。
请问有什么主意吗?
解决方法
您是否尝试过Geopandas Spatial加入?
使用pip安装软件包
pip install geopandas
或康达
conda install -c conda-forge geopandas
那么您应该能够将数据读取为GeoDataframe
import geopandas
df = geopandas.read_file("file_name1.csv") # you can read shp files too.
right_df = geopandas.read_file("file_name2.csv") # you can read shp files too.
# Convert into geometry column
geometry = [Point(xy) for xy in zip(df['longitude'],df['latitude'])] # Coordinate reference system : WGS84
crs = {'init': 'epsg:4326'}
# Creating a Geographic data frame
left_df = geopandas.GeoDataFrame(df,crs=crs,geometry=geometry)
然后您可以应用sjoin
jdf = geopandas.sjoin(left_df,right_df,how='inner',op='intersects',lsuffix='left',rsuffix='right')
op中的选项为:
- 相交
- 包含
- 内部
当您连接两个类型为Polygon和Point的几何列时,所有情况都应相同