问题描述
是否有一种方法可以通过考虑基因倍数变化（例如LFC）及其相应的p值来进行聚类分析？我的直觉是，在进行样本聚类时，尤其是对源自复杂疾病不同研究的数据进行聚类时，有些基因对样本差异的贡献要大于其他基因。考虑到这一点，我正在考虑同时使用基因LFC和p值来代表这一事实的分数，然后测量其欧几里德距离。我曾考虑过将LFC与-log10 p值相乘，但我想知道是否有合理的理由（统计或其他方式）？ 当然，最近提出的Topconfect软件包最接近于此方法，但是使用了其他方法，但是是否有比我提出的方法更好的理由？
解决方法
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