创建hdf5文件时始终出现权限错误

问题描述

我具有以下代码段来创建hdf5文件,并使用“ with”语句来确保正确关闭文件。但是,我仍然出现以下错误消息。

   filename = 'E30.hdf5'
   try:
        with h5py.File(filename,'w-') as f:
            print('---')
    except: 
        os.remove(filename)
        f = h5py.File(filename,'w-')     

但是,我仍然保持如下错误消息。在工作目录中,可能已经有一个名为“ E30.hdf5”的现有文件。但这真的重要吗?我试图直接从Windows删除它。但是,窗户不允许我删除它,因为它正在打开。

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OSError                                   Traceback (most recent call last)
<ipython-input-6-e8ccfbc1b5d2> in vid_to_hdf(En,start,end,chunk)
      9     try:
---> 10         with h5py.File(filename,'w-') as f:
     11             print('---')

~\AppData\Local\Continuum\anaconda3\envs\fastai-py37\lib\site-packages\h5py\_hl\files.py in __init__(self,name,mode,driver,libver,userblock_size,swmr,rdcc_nslots,rdcc_nbytes,rdcc_w0,track_order,**kwds)
    407                                fapl,fcpl=make_fcpl(track_order=track_order),--> 408                                swmr=swmr)
    409 

~\AppData\Local\Continuum\anaconda3\envs\fastai-py37\lib\site-packages\h5py\_hl\files.py in make_fid(name,fapl,fcpl,swmr)
    176     elif mode in ['w-','x']:
--> 177         fid = h5f.create(name,h5f.ACC_EXCL,fapl=fapl,fcpl=fcpl)
    178     elif mode == 'w':

h5py\_objects.pyx in h5py._objects.with_phil.wrapper()

h5py\_objects.pyx in h5py._objects.with_phil.wrapper()

h5py\h5f.pyx in h5py.h5f.create()

OSError: Unable to create file (unable to open file: name = 'E30.hdf5',errno = 17,error message = 'File exists',flags = 15,o_flags = 502)

During handling of the above exception,another exception occurred:

PermissionError                           Traceback (most recent call last)
<timed eval> in <module>

<ipython-input-6-e8ccfbc1b5d2> in vid_to_hdf(En,chunk)
     11             print('---')
     12     except:
---> 13         os.remove(filename)
     14         f = h5py.File(filename,'w-')
     15     # Create dataset within file

PermissionError: [WinError 32] The process cannot access the file because it is being used by another process: 'E30.hdf5'

解决方法

您一次遇到多个问题。 首先,让我们从h5py.File() access_mode标志开始。

  • w-:创建文件,如果存在则失败(避免意外覆盖现有文件)
  • w :创建文件,截断是否存在(意味着它会覆盖现有文件)
  • r + :读/写,文件必须存在(用于打开现有文件以写入数据)。

在下面的逻辑中,如果try:/except: 不存在,则您的try:模式将执行E30.hdf5语句。如果except: 存在,它将执行E30.hdf5语句。

这很复杂,因为每个分支使用不同的h5py.File()方法。您的try:分支使用with h5py.File() as f:方法。因此,当您的代码执行此逻辑时,文件将在末尾干净地关闭(没有f.close()语句)。

但是,您的except:分支使用f=h5py.File()。因此,当您的代码执行此逻辑时,您需要一个f.close()语句以确保最后关闭。

这是我认为您遇到的情况:

  1. 我假设您第一次运行代码时E30.hdf5不存在。
  2. 因此,第一次运行时,您经过try:分支,并且文件在末尾完全关闭。
  3. 下次运行代码时,E30.hdf5存在,因此,您将通过except:分支。结果,该文件不会在流程结束时关闭,并且另一个进程无法访问它(Python或OS)。

编码建议:

您的except:块具有相同的行为mode=w。以下代码的行为相同,并且在过程完成后将始终关闭文件。而且,它更具可读性(IMHO)。注意:这两种方法都会删除E30.hdf5(如果存在)。

filename = 'E30.hdf5'
with h5py.File(filename,'w') as f: # use mode=w
     print('---')

如果迫切需要保留try:/except:模式,请进行此更改:(将try:/except:用于访问模式w-r+,而无需使用{{ 1}}。)

os.remove(filename)

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