问题描述
我想在R包装饰图案中使用H2O，但这样做时遇到devtools::check()和devtools::build()的问题。小插图本身没有问题，可以正确编织并使用devtools::build_vignettes()正确构建。
将数据读入H2O时，H2O会写入一个临时文件以从R中导出数据并读入JAVA。我相信，这是一个问题，因为在检查和构建程序包时，两个函数都报告我没有权限打开与临时命令中文件的连接（请参见下面的代码）。该支票记录在Hadley Wickham和Jennifer Bryan的R包装书here中。
我尝试将本地TMPDIR项目文件中的环境变量.Renviron设置为其他目录，但没有成功。
我创建了一个minimal reproducible example on GitHub，这是一个非常基本的R包h2oVignette，其中包含使用H2O的小插图。克隆此程序包时，应该获得与我相同的错误（在Windows上）。
这是devtools::check()的输出：
> devtools::check()
-- Building ----------------------------------------------------- h2oVignette --
Setting env vars:
* CFLAGS : -Wall -pedantic -fdiagnostics-color=always
* CXXFLAGS : -Wall -pedantic -fdiagnostics-color=always
* CXX11FLAGS: -Wall -pedantic -fdiagnostics-color=always
--------------------------------------------------------------------------------
√ checking for file 'C:\Users\Roel.Verbelen\Documents\GitHub\h2oVignette/DESCRIPTION' (1.4s)
- preparing 'h2oVignette': (716ms)
√ checking DESCRIPTION Meta-@R_566_4045@ion ...
- installing the package to build vignettes
- creating vignettes ...Warning in file(con,"r") : (22.7s)
cannot open file 'C:/Users/ROEL~1.VER/AppData/Local/Temp\RtmpqIoM47\xshell3fb464c913': Permission denied
Error in file(con,"r") : cannot open the connection
Execution halted
Error in (function (command = NULL,args = character(),error_on_status = TRUE,:
System command 'Rcmd.exe' Failed,exit status: 1,stdout + stderr:
E> * checking for file 'C:\Users\Roel.Verbelen\Documents\GitHub\h2oVignette/DESCRIPTION' ... OK
E> * preparing 'h2oVignette':
E> * checking DESCRIPTION Meta-@R_566_4045@ion ... OK
E> * installing the package to build vignettes
E> * creating vignettes ...Warning in file(con,"r") :
E> cannot open file 'C:/Users/ROEL~1.VER/AppData/Local/Temp\RtmpqIoM47\xshell3fb464c913': Permission denied
E> Error in file(con,"r") : cannot open the connection
E> Execution halted
Type .Last.error.trace to see where the error occured
devtools::build()的输出：
> devtools::build()
√ checking for file 'C:\Users\Roel.Verbelen\Documents\GitHub\h2oVignette/DESCRIPTION' (1.1s)
- preparing 'h2oVignette': (801ms)
√ checking DESCRIPTION Meta-@R_566_4045@ion ...
- installing the package to build vignettes
- creating vignettes ...Warning in file(con,"r") : (23.5s)
cannot open file 'C:/Users/ROEL~1.VER/AppData/Local/Temp\Rtmp6B3dX9\xshell3df830451515': Permission denied
Error in file(con,"r") :
E> cannot open file 'C:/Users/ROEL~1.VER/AppData/Local/Temp\Rtmp6B3dX9\xshell3df830451515': Permission denied
E> Error in file(con,"r") : cannot open the connection
E> Execution halted
Type .Last.error.trace to see where the error occured
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解决方法
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