Snakemake-您可以从作业脚本中访问作业属性吗?

问题描述

默认的snakemake作业脚本如下:

#!/bin/sh
# properties = {properties}
{exec_job}

我已对其进行一些修改以打印一些有用的信息:

#!/bin/sh
# properties = {properties}
hostname=`hostname`
echo "Running on $hostname"
startTime=`date`
echo "Start time: $startTime"
{exec_job}
endTime=`date`
echo "End time: $endTime"

,我在执行工作流程时会通过--jobscript选项进行传递。
我想补充一点信息-使用了多少个CPU。如何访问作业的此(和其他)属性?也许与神秘的# properties = {properties}行有关?但是这些属性到底是如何使用的?
不胜感激,因为文档对此很含糊。
谢谢!

解决方法

暂无找到可以解决该程序问题的有效方法,小编努力寻找整理中!

如果你已经找到好的解决方法,欢迎将解决方案带上本链接一起发送给小编。

小编邮箱:dio#foxmail.com (将#修改为@)

相关问答

依赖报错 idea导入项目后依赖报错,解决方案:https://blog....
错误1:代码生成器依赖和mybatis依赖冲突 启动项目时报错如下...
错误1:gradle项目控制台输出为乱码 # 解决方案:https://bl...
错误还原:在查询的过程中,传入的workType为0时,该条件不起...
报错如下,gcc版本太低 ^ server.c:5346:31: 错误:‘struct...