Snakemake-您可以从作业脚本中访问作业属性吗?

问题描述

认的snakemake作业脚本如下:

#!/bin/sh
# properties = {properties}
{exec_job}

我已对其进行一些修改以打印一些有用的信息:

#!/bin/sh
# properties = {properties}
hostname=`hostname`
echo "Running on $hostname"
startTime=`date`
echo "Start time: $startTime"
{exec_job}
endTime=`date`
echo "End time: $endTime"

,我在执行工作流程时会通过--jobscript选项进行传递。
我想补充一点信息-使用了多少个cpu。如何访问作业的此(和其他)属性?也许与神秘的# properties = {properties}行有关?但是这些属性到底是如何使用的?
不胜感激,因为文档对此很含糊。
谢谢!

解决方法

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