读取使用pyarrow保存为实木复合地板的DataFrame,将文件名保存在列中

问题描述

我想读取一个充满包含pandas DataFrames的镶木地板文件文件夹。除了要读取的数据外,我还想将要从中读取数据的文件名存储在“ file_origin”列中。在大熊猫中,我可以这样:

import pandas as pd
from pathlib import Path

data_dir = Path("path_of_folder_with_files")
df = pd.concat(
                pd.read_parquet(parquet_file).assign(file_origin=parquet_file.name)
                for parquet_file in data_dir.glob("*")
            )


不幸的是,这很慢。 pyarrow(或其他任何有效的软件包)有类似的方法吗?

import pyarrow.parquet as pq

table = pq.read_table(data_dir,use_threads=True)
df = table.to_pandas()

解决方法

您可以使用箭头而不是熊猫来实现它:

batches = []
for file_name in data_dir.glob("*"):
    table = pq.read_table(file_name)
    table = table.append_column("file_name",pa.array([file_name]*len(table),pa.string()))
    batches.extend(table.to_batches())
return pa.Table.from_batches(batches)

除非您的表中有很多字符串和对象(在熊猫中很慢),否则我认为它不会显着提高速度。