问题描述
我的目标是使用sparklyR中的ml_corr函数计算缺少值的数据的相关矩阵。
为简单起见,我使用ml_corr文档中提供的示例。 https://www.rdocumentation.org/packages/sparklyr/versions/1.3.1/topics/ml_corr
我使用NaN添加了5.1的缺失值(无论哪个值都无关紧要),但我也尝试了NULL和NA,结果相同。
sc <- spark_connect(master = "local")
iris_tbl <- sdf_copy_to(sc,iris,name = "iris_tbl",overwrite = TRUE)
# Add in a missing value for the example
iris_tbl <- iris_tbl %>% mutate(Sepal_Length = ifelse(Sepal_Length == 5.1,NaN,Sepal_Length))
features <- c("Petal_Width","Petal_Length","Sepal_Length","Sepal_Width")
ml_corr(iris_tbl,columns = features,method = "pearson")
这将导致错误:“原因:org.apache.spark.SparkException:汇编值不能为空。”
我不希望删除整个行,因为我们仍然可以使用该行进行“ Petal_Width”和“ Petal_Length”之间的关联。此外,针对非火花数据帧的corr函数允许成对删除。
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解决方法
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