R / RStudio无法运行,套接字连接错误

问题描述

几天前,我在使用'brms'在R中运行模型时遇到错误,该错误表明我的后验样本不存在。在进一步阅读之后,这些链接1234)使我认为,在使用我的macOS(Catalina 10.15.6)时这是一个比较大的问题。 。 我遵循了他们的指示,即:

-更新了Rcpp,rstan,arm和brms程序包

-按照以下变通方法说明来更改stan的“并行”设置:https://github.com/rstudio/rstudio/issues/6692

-更新了R和RStudio,因为据说该问题是几个月前使用R 4.0修复的

-更新了XCode 11,Quartz 11,GNU Fortran 8.2

-更新了最新的macOS Catalina错误修复程序

-ran sudo rm -rf [R的路径]以卸载R

-试图彻底卸载所有R和RStudio文件包括删除我的Library / Frameworks文件夹中的文件,库/首选项中的任何.plist文件以及任何.Rprofile,.Rscript,.Rapp,.Rhistory,或.Renvirons文件

-重新启动后重新安装的R和RStudio

现在,我正在经历一些超级怪异的行为,而不是从头开始。首先,RStudio在完全白色的空白屏幕上打开,并且永远不会加载。其次,当我尝试通过终端或使用R Console直接打开R时,我陷入了将近20分钟的循环,说:

Error in socketConnection("localhost",port = port,server = TRUE,blocking = TRUE,: 
  file descriptor is too large for select()
Calls: <Anonymous> ... makePSOCKcluster -> newPSOCKnode -> socketConnection
Execution halted
Error in socketConnection("localhost",: 
  cannot open the connection
Calls: <Anonymous> ... makePSOCKcluster -> newPSOCKnode -> socketConnection
In addition: Warning message:
In socketConnection("localhost",:
  port 11537 cannot be opened
Execution halted

最后,当它终于永远停止循环时,它说:

/Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.0/Resources/bin/R: cannot make pipe for command substitution: Too many open files
ERROR: option '-e' requires a non-empty argument
rm: /var/folders/54/km__8z8x78x8_ct1pw8w8bbh0000gn/T//RtmpVORdTy: Too many open files

我无法访问控制台或在R中输入任何内容来尝试进行故障排除。而且,这会严重影响我的计算机,并且活动监视器显示有150多个“ R”进程正在运行,只有在终端中使用“ killall R”后,退出R进程才会消失。

但是,由于我们在计算机上创建了一个全新的用户,安装了R和RStudio,并且加载它们没有问题,因此IT部门的一位人士帮助我确定了这是我的Mac用户库或首选项中的问题。

我只是一个心理学研究生,所以我真的不理解使R起作用的后端,而我完全被这些症状所困扰。

我怀疑这些链接567)可能会有所帮助,但我不知道如何执行解决方案,因为现在我无法输入或在R中运行任何内容,而不会触发“执行暂停”的无限循环。

我真的可以用一只手,谢谢!

解决方法

暂无找到可以解决该程序问题的有效方法,小编努力寻找整理中!

如果你已经找到好的解决方法,欢迎将解决方案带上本链接一起发送给小编。

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