问题描述
我正在使用雀跃包中的pgsl函数进行系统发生广义线性模型分析。我有几个类别变量，其中一些具有两个以上的级别。
该模型似乎可以很好地处理各种因素，但是不确定这是否可行，因为我已经了解到pgsl框架需要虚拟变量（Symons和Blomberg 2014：“预测变量也可以是连续的，但是PGLS可以处理伪连续序数数据和二进制离散数据，如果将它们重新编码为单独的数据，则可以在PGLS框架内处理具有非常规特性的多状态离散变量（例如饮食：食虫性，草食性，食肉性等）。二进制字符（例如piscivory：否（0）或是（1））。”）
我应该使用哪种方法，因素还是假人？我都尝试过这两种方法，结果取决于使用的是哪一种。
Symons and Blomberg2014。在书中：现代系统发育比较方法及其在进化生物学中的应用。本章：系统发育广义最小二乘入门。出版商：Springer-Verlag Berlin Heidelberg。编辑：L. Z. Garamszegi
解决方法
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