问题描述
我正在阅读由Farrington 等人(2001)撰写的一篇研究文章“根据年龄分层的血清学调查数据估算传染病的基本繁殖数量”。我正在遵循他们的方法论,因此有一个理解上的问题。
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我有一份血清学数据,可以告知每个年龄段的血清阳性和血清阴性的人数。
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假定血清反应阳性的可能性遵循伽玛函数格式,并带有三个参数A,B和C。
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我通过计算二项式对数似然来拟合这些血清学数据。 在这里,我在R程序中使用了“优化”,并且成功地估计了最大化对数似然性的参数。
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我可以使用fisher信息获得置信区间(CI)的上限和下限。 (当我使用“优化”过程时,通过设置“ hessian = T”来计算渔夫信息。)
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到目前为止,我获得了估计参数A,B和C,其CI为95%。
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我主要关心的是估计基本复制数([R_ {0}] )以及使用配置文件似然法的CI。
R_ {0} = \ frac {\ int_ {0} ^ {\ infty}(Ax ^ Bexp(-x / C))^ {2} dx} {\ int_ {0} ^ {\ infty}( Ax ^ Bexp(-x / C))^ {2} exp {Ax ^ Bexp(-x / C)} dx}
有帮助吗?
P.S。这是我第一次上传问题。可悲的是,我在表达方程式时遇到问题。在这里我使用了乳胶形式,但是...
解决方法
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