可视化3D GMM

问题描述

我想知道是否存在一种以3D方式显示Mclust中的群集的方法。我知道您可以2D可视化群集，但是我对添加第3维感到好奇。你怎么做到的？

library(mclust
library(factoextra)
df<-data.frame(scale(iris[,-5]))
co<-Mclust(df,G=1:5)
fviz_mclust(co,"BIC",palette = "jco") # visualize optimal model and BIC values
fviz_mclust(co,"classification",geom = "point") # visualize clusters in 2D

解决方法

我认为fviz_mclust没有3D图。但是，您可以改用以下代码在iris中以3种功能显示3D群集：

library(plot3D)
scatter3D(df[,1],df[,2],3],bty = "g",pch = 18,colvar =co$classification,col.var = co$classification,colkey =F,col = c("#1B9E77","#D95F02"),ticktype = "detailed")