问题描述
我已经编写了一个Python程序包(完整的code on Github)并添加了Travis CI。由于一次测试,目前pipeline is failing。
我在包中有一个YAML配置文件作为备用。我不想重写那部分代码,所以我真的想要一个文件路径。
这是测试失败:
import os
def get_symbols_filepath(testing: bool = False) -> str:
"""Get the filepath of the symbols YAML file."""
pkg_root = os.path.dirname(sys.modules[__package__].__file__)
return os.path.join(pkg_root,"./misc/symbols_tiny.yml")
该部分的代码是:
MANIFEST.in
它在包装中吗?
我的include hwrt/misc/symbols_tiny.yml
中有这个:
setup.py
这在我的from setuptools import setup
setup(
package_data={"hwrt": ["misc/*"]},...
)
中:
python setup.py sdist
当我运行copying hwrt/misc/symbols_tiny.yml -> hwrt-0.2.1/hwrt/misc
时,它是源代码发行版(adding 'hwrt/misc/symbols_tiny.yml'
)的一部分,它也位于(tox
)中。
毒物
奇怪的是,它在pkg_resources.resource_filename(__name__,path)
中本地工作。
我迷路了。为什么它在Travis上失败了?我应该如何访问该文件?我还尝试了Scan Proteins
1 7:: [sp|P02787|TRFE_HUMAN Serotransferrin OS=Homo sapiens GN=TF PE=1 SV=3 ||| sp|TRFE_HUMAN| ||| tr|B4DHZ6|B4DHZ6_HUMAN Transferrin,isoform CRA_c OS=Homo sapiens GN=TF PE=2 SV=1]
2 21:: [sp|P01876|IGHA1_HUMAN Ig alpha-1 chain C region OS=Homo sapiens GN=IGHA1 PE=1 SV=2 ||| sp|P01877|IGHA2_HUMAN Ig alpha-2 chain C region OS=Homo sapiens GN=IGHA2 PE=1 SV=3]
3 2:: [sp|P14543|NID1_HUMAN Nidogen-1 OS=Homo sapiens GN=NID1 PE=1 SV=3 ||| tr|B4DM05|B4DM05_HUMAN cDNA FLJ51241,highly similar to Nidogen-1 OS=Homo sapiens PE=2 SV=1]
。它也可以在“之前”工作...我不知道为什么现在失败或发生了什么变化。
解决方法
暂无找到可以解决该程序问题的有效方法,小编努力寻找整理中!
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