存储带有位置和权重属性的networkx图以实现Gephi可视化

问题描述

给定数据集X和权重矩阵W，网络图G由下式给出

G = nx.Graph(W.todense())
pos = {i: list(p) for i,p in enumerate(X)}
nx.set_node_attributes(G,pos,'pos') 

图G具有以下结构：

我们可以用权重和节点位置属性来存储图G以便将G加载到Gephi中并使用这些属性可视化图吗？

谢谢。

解决方法

您已经定义了节点的属性，因此只需将其保存为Gephi可接受的文件即可，方法如下：

nx.write_gexf(
G,path,encoding='utf-8',prettyprint=True)

顺便说一句，稍后，您可以将任何属性分配给.csv格式的节点或边，然后将其读取并添加到Gephi中的当前图形中（这可能是另一种选择）