问题描述
如果我的矩阵结构如下:
A B C D E F
A - 12 3 5 7 9
B - - 8 11 6 2
C - - - 10 1 7
D - - - - 17 1
E - - - - - 19
F - - - - - -
我想将A-F分为2组,并找到总和最小的组合。 (如果组合为[ACD,BEF],则总和为(3 + 5 + 10)+(6 + 2 + 19)= 45。)
在真实数据集中,将有一个2700X2700矩阵,我想将它们分为13组200个项目和1组100个项目(13x200 + 1x100 = 2700)。 python或R代码中有没有一种好的方法来解决这个问题?
谢谢。
更新:
谢谢@ jay.sf。确实,gene2列表使用模拟数据集回答了我的问题,但是在输出中,gene1列表始终是“ DEF”。
我可以忽略下面的行“ attr(s,“ group1”)
但是,当涉及多个组和大型数据集(将2700行X列分成100个组)时,comboGeneral()无法工作。目前,尽管我的参数中没有参数“ FUN”,但我正在尝试使用comboGroups()。
解决方法
暂无找到可以解决该程序问题的有效方法,小编努力寻找整理中!
如果你已经找到好的解决方法,欢迎将解决方案带上本链接一起发送给小编。
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