从矩阵中所有可能的分割组合中找到最小和

问题描述

如果我的矩阵结构如下:

    A  B  C  D  E  F
A   -  12 3  5  7  9
B   -  -  8  11 6  2
C   -  -  -  10  1  7 
D   -  -  -  -  17 1 
E   -  -  -  -  -  19
F   -  -  -  -  -  - 

我想将A-F分为2组,并找到总和最小的组合。 (如果组合为[ACD,BEF],则总和为(3 + 5 + 10)+(6 + 2 + 19)= 45。)

在真实数据集中,将有一个2700X2700矩阵,我想将它们分为13组200个项目和1组100个项目(13x200 + 1x100 = 2700)。 python或R代码中有没有一种好的方法来解决这个问题?

谢谢。

更新:

谢谢@ jay.sf。确实,gene2列表使用模拟数据集回答了我的问题,但是在输出中,gene1列表始终是“ DEF”。

我可以忽略下面的行“ attr(s,“ group1”)

但是,当涉及多个组和大型数据集(将2700行X列分成100个组)时,comboGeneral()无法工作。目前,尽管我的参数中没有参数“ FUN”,但我正在尝试使用comboGroups()。

解决方法

暂无找到可以解决该程序问题的有效方法,小编努力寻找整理中!

如果你已经找到好的解决方法,欢迎将解决方案带上本链接一起发送给小编。

小编邮箱:dio#foxmail.com (将#修改为@)