软件包“ xxx”是在R 4.0.0之前安装的：请重新安装已经完成全新安装并检查了lib路径

问题描述

我从二进制文件在R 4.0.2中安装软件包时遇到了一些问题。这是我的尝试：

> install.packages("C:/Users/Mnestor/Downloads/libSBML_5.18.0.zip",repos = NULL,type = "win.binary")
Installing package into ‘C:/Users/Mnestor/Documents/R/win-library/4.0’ (as ‘lib’ is unspecified)
package ‘libSBML’ successfully unpacked and MD5 sums checked
Warning messages:
1: multiple methods tables found for ‘type’ 
2: multiple methods tables found for ‘type<-’ 

下一步，我加载库：

> library('libSBML')
Error: package or namespace load Failed for ‘libSBML’:
 package ‘libSBML’ was installed before R 4.0.0: please re-install it

此错误令我感到困惑，因为我正在R 4.0.2中工作，并且显然刚刚完成了全新安装。

我尝试过

1. 删除库文件夹并重新安装
2. 运行remove.packages('libSBML')并重新安装

作为参考，这是我的图书馆目录：

> .libPaths()
[1] "C:/Users/Mnestor/Documents/R/win-library/4.0"
[2] "C:/Program Files/R/R-4.0.2/library"   

libSMBL文件夹位于第一个库路径中，而不是第二个（如预期的那样）。

以下是会话信息：

> sessionInfo()
R version 4.0.2 (2020-06-22)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
Running under: Windows 10 x64 (build 17134)

Matrix products: default

locale:
[1] LC_COLLATE=English_United States.1252  LC_CTYPE=English_United States.1252   
[3] LC_MONETARY=English_United States.1252 LC_NUMERIC=C                          
[5] LC_TIME=English_United States.1252    

attached base packages:
[1] parallel  stats     graphics  Grdevices utils     datasets  methods   base     

other attached packages:
[1] rsbml_2.46.0        Biocgenerics_0.34.0

loaded via a namespace (and not attached):
[1] BiocManager_1.30.10 compiler_4.0.2      tools_4.0.2         remotes_2.2.0      
[5] stats4_4.0.2        SBMLR_1.84.0        graph_1.66.0  

解决方法

该错误消息可能有点令人困惑，但是它表示该软件包已经针对R的早期版本进行了编译（这就是“ win.binary”选项的含义）。

由于更新的编译器和构建工具，

R 4.0和早期版本的二进制文件不兼容。

您需要从源代码安装软件包，这可能意味着安装R工具（https://cran.r-project.org/bin/windows/Rtools/），或者您需要使用为R 4.0或更高版本预先构建的版本。