从Julia调用Python

问题描述

我是Julia的新手,我有一个要在Julia中使用的Python函数。基本上,该函数的作用是接受数据帧(作为numpy ndarray传递),过滤器值和列索引列表(来自数组),并使用Python中的statsmodels包运行逻辑回归。到目前为止,我已经尝试过:

using PyCall

py"""
import pandas as pd
import numpy as np
import random
import statsmodels.api as sm
import itertools
def reg_frac(state,ind_vars):
    rows = 2000
    total_rows = rows*13
    data = pd.DataFrame({
    'state': ['a','b','c','d','e','f','g','h','i','j','k','l','m']*rows,\
    'y_var': [random.uniform(0,1) for i in range(total_rows)],\
    'school': [random.uniform(0,10) for i in range(total_rows)],\
    'church': [random.uniform(11,20) for i in range(total_rows)]}).to_numpy()
    try:
        X,y = sm.add_constant(np.array(data[(data[:,0] == state)][:,ind_vars],dtype=float)),np.array(data[(data[:,0] == state),1],dtype=float)
        model = sm.Logit(y,X).fit(cov_type='HC0',disp=False)      
        rmse = np.sqrt(np.square(np.subtract(y,model.predict(X))).mean())
    except:
        rmse = np.nan
    return [state,ind_vars,rmse] 
"""

reg_frac(state,ind_vars) = (py"reg_frac"(state::Char,ind_vars::Array{Any}))

但是,当我运行此命令时,我并不期望结果为NaN。我认为它正在运行,但是我缺少一些东西。

reg_frac('b',Any[i for i in 2:3])

  0.000244 seconds (249 allocations: 7.953 KiB)
3-element Array{Any,1}:
    'b'
    [2,3]
 NaN

感谢您的帮助。

解决方法

在Python代码中,您拥有str,而在Julia代码中,您拥有Char,这是不一样的。

Python:

>>> type('a')
<class 'str'>

朱莉娅:

julia> typeof('a')
Char

因此,您的比较无效。 您的函数可能如下所示:

reg_frac(state,ind_vars) = (py"reg_frac"(state::String,ind_vars::Array{Any}))

现在:

julia> reg_frac("b",Any[i for i in 2:3])
3-element Array{Any,1}:
  "b"
  [2,3]
 0.2853707270515166

但是,我建议使用Vector{Float64},而不是使用Vector{Any}来将PyCall实时转换为numpy向量,因此看起来您的代码仍然可以改进(取决于您实际计划的内容)要做)。