无法通过conda env访问jarfile

问题描述

我通过conda下载了一个名为“ beagle”的Java软件(已经安装了 java-jdk java )。当我运行Nextflow(NF)管道(在NF的过程中使用软件)时,它说:

无法访问jarfile beagle.24Aug19.3e8.jar

我激活了conda env,检查了软件的位置,它在其中

/share/beagle-5.1_24Aug19.3e8-0/beagle.jar

示例用法如下:

java -jar beagle.24Aug19.3e8.jar

所以,我的命令是正确的。我尝试了NF过程中的所有组合,例如:

  • java -jar /share/beagle-5.1_24Aug19.3e8-0/beagle.jar
  • java -jar beagle.24Aug19.3e8.jar
  • java -jar beagle.jar
  • java -jar /share/beagle-5.1_24Aug19.3e8-0/beagle.24Aug19.3e8.jar

我想念什么?为什么无法访问?谢谢!

干杯

解决方法

好的,我解决了,但是忘了在这里更新。实际上,工具手册说该软件的使用应与以下软件一起使用:

java -jar beagle.jar

它仅与“ beagle ”命令一起使用。未删除该帖子,因为它可能对其他事情很有帮助。

干杯