从group1,group2,overlap_count创建重叠矩阵?

问题描述

我有一个数据框,其中g1,g2代表两组,还有一个val列,表示在g2中还可以找到g1中有多少项。

## Input dataframe
data.frame(
  g1 = c('a','a','b','c','d'),g2 = c('a',val = c(10,4,1,5,3,4),stringsAsFactors = FALSE
)

我在格式化数据框时遇到如下问题。我可以使用g1 / g2创建一个具有不同列/行名称的空命名矩阵,并遍历输入数据帧中的每一行,并将其值写入匹配的g1:row-id g2:column-id组合,但这似乎效率低下我想知道是否有任何库提供了一种使它自动化的方法?

## Output overlap matrix
data.frame(a = c(10,0),b = c(4,c = c(1,d = c(0,row.names = c('a','d'))

之前有人问过与overlap between groups类似的问题,但是-我们有一个组及其中的项目的列表,并希望找出组之间有多少个项目重叠。

在这里,我知道组之间有多少项重叠,但是在正确设置格式方面遇到了麻烦。

解决方法

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