问题描述
我最近在命令行中尝试了bcftools
命令(以处理变体文件)。
下面给出了我尝试过的命令
bcftools merge --force-samples -O z -o final.vcf.gz ethn.vcf.gz
但是,该命令正在运行,但是合并花费了很长时间。因此,我让系统通宵运行以使其运行。
但是,当我醒来时,我发现系统由于电量耗尽而关闭了
我怎么知道我在Unix / Linux终端中的最后一个命令是否成功?
上面显示的命令只是一个示例。您甚至可以向我解释如何使用simple gzip operation
进行检查。
尽管我确实看到了final.vcf.gz
,但我不能说该命令是成功的,因为一旦命令开始运行,我就会看到该文件正在生成。所以,我不能依靠
请帮忙吗?
解决方法
如果是单线的,还可以尝试写入文件,例如:
bcftools merge --force-samples -O z -o final.vcf.gz ethn.vcf.gz && date > done.txt