ggforest不断给出“ [..data.frame`data，，var中的错误：未定义的列已选择”

问题描述

因此，我一直在尝试在林区图中可视化我的Cox模型结果，但始终收到错误Error in [。data.frame (data,var) : undefined columns selected。这在我看来有些奇怪。定义模型并提供摘要，结果如常打印，似乎没有问题。此外，模型不包含strata()和tt()对象。经过一番谷歌搜索，这似乎是不时发生的错误，但是我找不到任何令人满意的有效解决方案来管理它。鉴于所有其他功能都能正常工作，我很确定这实际上与数据本身无关。

或者，对于任何建议如何对结果进行信息性概述的建议，我也感到非常高兴，尤其是当我的其他一些模型包含层次结构时，ggforest似乎不支持它。

编辑：我发现了问题：在coxph函数中指定ID参数时，我得到未定义的列选择错误。

duration_analysis_10 <- coxph(formula = Surv(start1,stop1,event) ~ Var1 + 
                                Var2 +  
                                log(Var3)+ 
                                Var4 + Var5 + 
                                Var6 +
                                Var7 + Var8 +
                                Var9 + Var10 +
                                var11 + Var12 + 
                                Var13,ties = "efron",na.action = na.exclude,id = CountryName,data = df)

来自eha软件包的可复制样本：

oldmort <- arrange(oldmort,id)
oldmort$event <- ifelse(oldmort$event == "TRUE",1,0)

oldmort$sex <- ifelse(oldmort$sex == "female",0)

oldmort$id <- as.character(oldmort$id)


oldmorttest <- coxph(formula = Surv(enter,exit,event) ~ imr.birth + sex,id = id,data = oldmort)

summary(oldmorttest)


ggforest(oldmorttest,data = oldmort)

解决方法

暂无找到可以解决该程序问题的有效方法，小编努力寻找整理中！

如果你已经找到好的解决方法，欢迎将解决方案带上本链接一起发送给小编。

小编邮箱:dio#foxmail.com (将#修改为@）

ggplot2 r r survminer