创建mRNA前GTF

问题描述

我正在尝试为我的snRNA数据创建前mRNA参考。这是我的命令

cellranger mkref --genome=mm10-2020-A_premrna \
                 --fasta=refdata-gex-mm10-2020-A/fasta/genome.fa \
                 --genes=mm10-2020-A.premrna.gtf

我开始执行该命令后就开始收到此错误

在/home/users/umatha/yard/apps/cellranger-3.1.0/mm10-2020-A_premrnaa中创建新的参考文件夹 ...完成

将基因组FASTA文件写入参考文件夹... ...完成

计算基因组FASTA文件的哈希... ...完成

索引基因组FASTA文件... ...完成

将基因GTF文件写入参考文件夹... GTF第1行中的无效列数：/home/users/yard/apps/cellranger-3.1.0/cellranger-cs/3.1.0/bin

我是新来的。有人可以帮我解决这个问题！

解决方法

暂无找到可以解决该程序问题的有效方法，小编努力寻找整理中！

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