如何更改RS4类属性的默认值-rpy2

问题描述

我通过执行以下操作在python中映射RS4类：

from rpy2.robjects.packages import importr
import rpy2.robjects as ro

class MapTOS4(ro.methods.RS4):
    """
    writing a child class to map to S4 reference class in python
    """
    def LoadFile(self,filename):
        """access the LoadFile method of SlicedData class"""

        return ro.baseenv['$'](self,'LoadFile')(filename)
    
    def fileSliceSize(self):
        """access the class attribute or field""" 
        return ro.baseenv['$'](self,'fileSliceSize')
    
mql = importr('MatrixEQTL')
data = MapTOS4(mql.SlicedData())
print(data.fileSliceSize())

执行上述代码时，我得到了以下[1] 1000，这是因为在该特定程序包中，类字段/属性fileSliceSize的默认值设置为1000。但是，我试图将该类属性的值重置或更改为2000。

在R中，您可以使用以下简单的代码轻松做到这一点：

data$fileSliceSize = 2000 

如何基于我在Python中的实现来实现这一目标？

非常感谢您。

解决方法

在R中，data$fileSliceSize = 2000操作只是一个语法糖，用于调用带有三个参数（ object ， key ， value ）：

$<-

与library(MatrixEQTL) data = SlicedData() `$<-`(data,'fileSliceSize',2000) # SlicedData object. For more information type: ?SlicedData # Number of columns: 0 # Number of rows: 0 # Data is stored in 0 slices 访问相同的方式是以下语法糖：

data$fileSliceSize

该技巧用于转义函数名称中的特殊字符-您可以使用反引号调用任何R函数：

`$`(data,'fileSliceSize')
# [1] 2000

请参阅R文档的Extract chapter。

因此，在rpy2中，您可以简单地执行以下操作：

`print`('text')
# [1] "text"

但是，我建议您尝试一种更“ pythonic”的方法（为简洁起见，省略了文档字符串）：

ro.baseenv['$<-'](data,2000)