dplyr :: across找不到所有内容或管道中的点

问题描述

遵循?across的文档：

across(.cols = everything(),.fns = NULL,...,.names = NULL)

我使用everything()作为LHS的参考。

everything()和.似乎都没有从管道接收LHS对象。

我想念什么？

Repex：

library(dplyr)
# this works as expected
iris %>%
  select(Sepal.Length:Petal.Width) %>%
  mutate_all(as.character) %>% glimpse

Rows: 150
Columns: 2
$ Sepal.Length <chr> "5.1","4.9","4.7","4.6","5","5.4","5…
$ Sepal.Width  <chr> "3.5","3","3.2","3.1","3.6","3.9","3.4","3…

# this doesn't work
iris %>%
  select(Sepal.Length:Sepal.Width) %>%
  mutate(across(.cols = everything(),.fns = as.character)) %>% glimpse

Rows: 150
Columns: 2
$ Sepal.Length <dbl> 5.1,4.9,4.7,4.6,5.0,5.4,4.4,…
$ Sepal.Width  <dbl> 3.5,3.0,3.2,3.1,3.6,3.9,3.4,2.9,…

解决方法

经过繁琐的试验和错误后，我找到了解决方案。 我发布该邮件是因为我认为它并不简单，尤其是对于dplyr的初学者。

发生此问题的原因是dplyr库调用中的mutate可能被plyr库覆盖。棘手的方面是，后者库是作为其他库的依赖项加载的。在这种情况下，您需要在加载库后仔​​细阅读警告消息。

在我的情况下，plyr由ggbiplot加载：

library(ggbiplot)
Loading required package: plyr
-----------------------------------------------------------------------
You have loaded plyr after dplyr - this is likely to cause problems.
If you need functions from both plyr and dplyr,please load plyr first,then dplyr:
library(plyr); library(dplyr)
-----------------------------------------------------------------------

重要的是，警告消息明确命名了那些被覆盖的dplyr函数：

Attaching package: ‘plyr’

The following objects are masked from ‘package:dplyr’:

    arrange,count,desc,failwith,id,mutate,rename,summarise,summarize

在这种情况下，修复很容易：

library(plyr)
library(dplyr)
library(ggiplot)

我认为最安全的方法是确保从dplyr调用每个dplyr函数：

iris %>%
  dplyr::select(Sepal.Length:Sepal.Width) %>%
  dplyr::mutate(across(.cols = everything(),.fns = as.character)) %>% glimpse