评估R中的聚类结果

问题描述

我使用nmf包进行了迭代聚类。

详细地说，我每次使用500次随机观察（从〜15000次观察中采样）和78个固定变量（将nmf参数固定为2）运行rank函数100次。

然后我根据H <- coef(result)矩阵中的较大值将每个变量分配给两个群集之一。

现在我有一个78 x 100矩阵，在其中存储了组分配的结果。

问题是，如何评估/区分类似后续情况（聚类相同但符号不同）：

   V1 V2
1  k1 k2
2  k2 k1
3  k2 k1
4  k1 k2
5  k1 k2

由此（相同的聚类和相同的符号）：

   V1 V3
1  k1 k1
2  k2 k2
3  k2 k2
4  k1 k1
5  k1 k1

并且由此（群集有所不同）：

   V1 V4
1  k1 k1
2  k2 k1
3  k2 k2
4  k1 k1
5  k1 k2

我无法控制表示法。 换句话说，我想评估同一变量聚在一起的频率。

谢谢

解决方法

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