问题描述
我要做的任务很简单，但是由于内存问题，我无法完成它。所以我想知道是否有更有效的方法来做到这一点。 我有一个大的data.frame，像这样：
此数据帧称为sp_df，我用R计算每个点之间的距离。问题是，由于其较大，我无法将其融合为矩阵。那就是我被封锁的地方。
sp_df <- read.csv("Euclidean_80K_Spots.csv",h=T)
sp_dist <- dist(sp_df)
sp_dist_m <- melt(as.matrix(sp_dt),varnames = c("ID","neig"))
dist对象为16.2 Gb，由于其生物学特性，我无法将数据分成几小块。我所能做的就是过滤器dist并仅使dist
解决方法
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