Biopython现在无法下载.PDB文件

问题描述

我在Biopyhton遇到了麻烦。我用这段代码下载了一组蛋白质

from Bio.PDB import *
from biopandas.pdb import PandasPdb
import Bio
from Bio.PDB import PDBList
ppdb0 = []
ppdb1 = []
pdbl = PDBList()
PDBlist2 = ['2dd6','1lbO','iee7']
for i in PDBlist2:
    ppdb0.append(pdbl.retrieve_pdb_file(i,pdir='.',file_format ='pdb'))
    ppdb1.append(PandasPdb().fetch_pdb(i))

它工作得很好，但是现在重新启动计算机后，我出现了此错误：

Downloading PDB structure '2dd6'...
Desired structure doesn't exists
Downloading PDB structure '1lbO'...
Desired structure doesn't exists
HTTP Error 404

有人能得到相同的吗？你能告诉我如何解决这个问题吗？帕德：如果我用大写字母写蛋白质登录号也一样

解决方法

暂无找到可以解决该程序问题的有效方法，小编努力寻找整理中！

如果你已经找到好的解决方法，欢迎将解决方案带上本链接一起发送给小编。

小编邮箱:dio#foxmail.com (将#修改为@）

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