R函数pd-不同的树，相同的丰富度？

问题描述

我在R中两次使用了pd()函数：

两次，我都使用相同的数据社区矩阵。但是提供的树是不同的。我想找出依赖于不同树（数据的不同聚类）的样本的alpha多样性。

pd()生成一个数据帧，其中包含样本，信念多样性PD和物种丰富度SR。两种情况下的PD不同，但SR相同。

使用pd()后SR相同的总体原因是什么？当Faith分集（即分支长度之和）不同时，那么丰富度（即占有簇）也应该不同。但事实并非如此，如我所解释。

我知道我应该提出一个建议，但我无法复制案件。我希望提出一般建议。也许有人正在经历同样的事情？

解决方法

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