问题描述
上下文
我正在尝试通过命令行将一些参数传递给函数。这些参数可以直接从命令行，配置文件中读取，也可以将两者结合使用以简化某些管道。例如：
for i in { 1 .. 100 }
do
python myprogram.py -i data_${i}.nii.gz -o results_${i} -cf configfile.ini
done
我的问题
我在read_configfile()中有两个函数read_commandline和myprogram.py可以正常工作，并以完全相同的输出格式提供字典args。如果打印出两个函数都返回的args变量，则会得到类似的信息：
{'data_path': '~/problem/data_X/','results_path': '~/problem/results_X/','base_path': '~/problem/','model_name': 'subject_X','data_name': 'data.nii.gz','image_file': None,'bvals_file': None,'bvecs_file': None,'brainmask_file': None,'header_init': None,'init_files': None,'cov_file': 'Analytic','njobs': 14,'slice_axis': None,'slice_n': None,'seed': None,'get_cov_samples': False,'num_sticks': 3,'snr': 30,'type_noise': 'Rician','framework': 'Matlab','optimizer': 'fmincon','cons_fit': True,'ard_optimization': False,'likelihood_type': 'Default','reparametrization': False,'no_run_mcmc': False,'mcmc_analysis': 'Hybrid1','burnin': 1000,'jumps': 1250,'thinning': 25,'adaptive': True,'period': 50,'duration': 'whole-run','no_ard_mcmc': False,'type_ard': 'Gaussian','ard_fudge': 1,'bingham_flag': False,'acg': False}
我想要的是映射字典args的内容以创建新变量（即用variableX代替args.variableX或{{1} }）。 args['variableX']是我要创建的变量的名称，而key是其各自的值。例如：
value我想尽可能做到最简洁，可扩展，所以我不想一个个手动分配。
我已经搜索并尝试了几种方法来执行此映射，例如列出的here和here（例如print(data_path)
~/problem/data_X/
print(period)
50
或locals().update(args)）。但是，它们全部都部分起作用。这些映射使大多数变量未定义（实际上在代码中稍后重新定义或重用的那些变量），可能是由于与命名空间发生某种冲突或某些我不了解的事情。
编辑
for i in list(args.keys()): exec(f'{i} = {args[i]}' def myprogram():
[...]
var1,var2,var3,....,var50 = read_params(logger,sys.argv[1:])
[other stuff]
def read_params(logger,argv):
# Only CONfigFILE
if isinstance(argv,str): # It is a string,i.e. a path (chain of characters) = Only configfile provided
logger.info('Reading parameters from configfile....')
args = read_configfile(argv)
# COMMAND LINE ParaMS
elif isinstance(argv,list): # Params introduced by terminal
logger.info('Reading parameters from command-line....')
args = read_params(argv)
# One (automatic) option that should work
locals().update(args)
print('Variables in locals():')
print(locals()) # It seems to be updated correctly to locals(). See print shown below
# Re-deFinition one by one. It works but I want to avoid this
# model_name = args['model_name']
# base_path = args['base_path']
# data_path = args['data_path']
# [...] # Repeat for the rest of variables
# If I use these updated variables from locals().update(args) anywhere in the code,it raises an Error.
if data_path is None:
if (os.path.isdir(os.path.join(base_path,'data/'))):
data_path = os.path.join(base_path,'data/')
sys.path += [data_path]
logger.info(f'Data path set in from {data_path}')
else:
logger.error(f'Error! Data path {data_path} does not exist.')
sys.exit()
[other similar stuff]
return data_path,...
def read_configfile(configfile):
# localconfig is a wrapper on top of configparser (so fully compatible) that makes easier to import the variables in correct data types using the same configfile
# https://pypi.org/project/localconfig/
from localconfig import config
config.read(configfile)
args = dict(list(config.args)) # returns a dict
return args
[...]
和错误：
print(locals())如您所见，Variables in locals():
{'logger': <Logger run_mybedpostX (DEBUG)>,'argv': '~/code/config/configfile_template.py','args': {'data_path': '~/code/data/','results_path': '~/code/results/','base_path': '~/code/','image_file': 'data.nii.gz','bvals_file': 'bvals','bvecs_file': 'bvecs','brainmask_file': 'nodif_brain_mask.nii.gz','model_name': 'model_1','header_init': 'pvmfit','init_files': '~/code/data/brain/PVMFIT/','cov_file': '~/code/results/3fib/covSPD.npy','njobs': 1,'seed': 1234,'full_report': False,'framework': 'None #Matlab','optimizer': 'None #','run_mcmc': True,'ard_mcmc': True,'acg': False,'bingham_flag': False},'bingham_flag': False}
Traceback (most recent call last):
File "/Applications/PyCharm.app/Contents/helpers/pydev/pydevd.py",line 1758,in <module>
main()
File "/Applications/PyCharm.app/Contents/helpers/pydev/pydevd.py",line 1752,in main
globals = debugger.run(setup['file'],None,is_module)
File "/Applications/PyCharm.app/Contents/helpers/pydev/pydevd.py",line 1147,in run
pydev_imports.execfile(file,globals,locals) # execute the script
File "/Applications/PyCharm.app/Contents/helpers/pydev/_pydev_imps/_pydev_execfile.py",line 18,in execfile
exec(compile(contents+"\n",file,'exec'),glob,loc)
File "~/code/main.py",line 214,in <module>
main(args)
File "~/code/main.py",line 72,in main
get_cov_samples,type_ard,ard_fudge,bingham_flag,acg = read_params(logger,args)
File "~/code/utils/read_params.py",line 98,in read_params
if data_path is None:
UnboundLocalError: local variable 'data_path' referenced before assignment
中的所有项目也作为单独的变量出现在args中（在locals()格之后）。实际上，在Pycharm中对其进行调试，我可以从Debug Console中对其进行调用。但是，如上所示，如果您运行脚本（即从函数调用），则会引发该错误。
解决方法
您尝试更新locals()或将exec与locals一起使用在Python 3中不起作用。在文档中也有与此类似的警告。 locals不再作为提高性能的命令而实现，而是一个固定大小的数组。
请记住，CPython已编译为字节码，由解释器 运行。编译函数时，局部变量存储在 固定大小的数组（不是字典）和变量名被分配给 索引。这是可能的，因为您无法动态添加本地 函数的变量。然后从字面上检索局部变量 在列表中查找指针，并在PyObject上增加refcount 这是微不足道的。
将此与全局查找（LOAD_GLOBAL）进行对比，这是正确的决定 搜索涉及哈希等等。顺便说一下，这就是为什么您需要 指定全局i如果您希望它是全局的：如果您曾经分配给 范围内的变量，编译器将为其发出STORE_FAST 除非您告知不要访问。
来自：Why does Python code run faster in a function?
可能的解决方法：
-
更新
globals而不是locals，它仍然有效，因为它仍然实现为dict。 警告：这是一个坏主意，在使用前应三思而后行，有更好的方法。 -
使用namespace。您希望字典的键是可以直接使用'。'访问的适当变量。运算符，否则您将需要使用
getattr来访问变量。
>>> from types import SimpleNamespace >>> args = {"data_path": "xyx/data","base_path": "xyz"} >>> n = SimpleNamespace(**args) >>> n.data_path 'xyx/data'
参考：
Why does Python code run faster in a function?