问题描述
我正在Rstudio的Windows计算机上开发一个闪亮的应用程序。现在，我需要在Linux机器上进行开发，之后再将其部署在服务器上。由于需要跨平台运行该应用程序，因此我正在研究一些环境控制应用程序，从而不必手动调整和重新安装所需的软件包。
我试图为此目的使用Packrat。我在Windows计算机上制作了快照，将项目复制并粘贴到了Ubuntu中，在RStudio上重新打开了该项目，安装了Packrat，并自动运行了软件包的还原。然后我遇到了一个问题，即某些需要系统依赖的软件包没有自动安装，例如rgdal和jqr。因此，我不得不在终端中手动安装这些系统依赖项（花了我一段时间，因为其中大约有10个需要额外的系统依赖项。）
我想知道是否有一种更简单的方法来自动处理此问题。稍后，我将需要与系统管理员一起将应用程序部署到服务器。我想知道Packrat是否具有在Linux机器/服务器上自动安装系统依赖项的功能。如果有人以前遇到过此问题，或者还有其他更好的选择，请告诉我！
谢谢！
解决方法
您好，欢迎来到StackOverflow。
您所面临的问题实际上比起初您想的要困难得多 ---在不同操作环境中部署 complex R程序包依赖系统是一个真正的困难，实际上，这是一个尚未解决的问题！
您当然可以将packrat和renv用于 R软件包的依存关系和特定版本的快照。但这对于系统级依赖项 不不做任何事情，这些依赖项被简单地视为“给定”。因此，不要只是转移到另一个盒子并说“ abracadabra”。抱歉！
我们可能最想解决此问题的可能是Docker，您可以在其中创建一个便携式执行单元，该单元可以部署在Docker运行的任何位置：Windows，macOS，不同的Linux版本，.. .。因为它可以对所有内容进行编码。