如何结合ggtree和直方图？

问题描述

我想结合ggtree生成的p和基于dat的直方图。系统发育树和直方图都有相同的条目，但是我观察到的唯一一件事是没有任何文本或直方图的系统发育树。我不明白为什么树和直方图不结合。

library(ggtree)
library(ggplot2)


tree <- read.tree("mammal2.nh")

#My newick file "mammal2.nh" is : 
#(((((((((((((((((((((((((Monodelphis domestica)Monodelphis)Didelphinae)Didelphidae)Didelphimorphia)Metatheria,(((((((((((Mus musculus)Mus)Mus)Murinae)Muridae)Muroidea)Myomorpha,(((((Marmota marmota)Marmota)Marmotini)Xerinae)Sciuridae)Sciuromorpha)Rodentia)Glires)Euarchontoglires)Boreoeutheria)Eutheria)Theria)Mammalia)Amniota,((((((((Xenopus laevis)Xenopus)Xenopus)Xenopodinae)Pipidae)Pipoidea)Anura)Batrachia)Amphibia)Tetrapoda)Dipnotetrapodomorpha)Sarcopterygii)Euteleostomi)Teleostomi)Gnathostomata)Vertebrata)Craniata)Chordata)Deuterostomia)Bilateria)EuMetazoa)Metazoa)Opisthokonta)Eukaryota)cellular_organisms);


p<- ggtree(tree,branch.length='none')



Name = list('Marmota Marmota','Monodelphis domestica','Mus musculus','Xenopus laevis')
pcnt = list(5,20,6,9)

dat <- do.call(rbind,Map(data.frame,Name=Name,pcnt=pcnt))


p2 <- geom_facet(p,panel  = 'aa',data=dat,geom=ggstance::geom_histogramh(),aes(x=pcnt,y=Name),stat="identity"
)

p2

这就是我最终想要的样子。面板“树”和“特征”。

解决方法

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