如何标记指向群集的数据？

编程问答 2022-06-11

问题描述

我已经完成并绘制了R markdown中的DBSCAN集群。

这是我目前的代码：

dbscan.8=fpc::dbscan(current.matrix,eps=2,MinPts=log(33359)) #list generated

fviz_cluster(dbscan.8,data=current.matrix,stand=FALSE,ellipse=FALSE,show.clust.cent=FALSE,geom="point",palette="jco",ggtheme=theme_classic()) # Plot the clusters

如何在原始数据帧（current.matrix）中添加一个新列，其中包含每一行所属的簇？所以看起来像这样：

enter image description here

谢谢！

解决方法

使用示例数据集：

library(factoextra)
library(fpc)

dat = data.frame(scale(iris[,-5]))

clus = dbscan(dat,1.5)

集群看起来像这样

viz = fviz_cluster(clus,data=dat,stand=FALSE,ellipse=FALSE,show.clust.cent=FALSE,geom="point",palette="jco")

print(viz)

enter image description here

集群信息已经存储在来自fviz_cluster的对象中：

head(viz$data)
  name         x          y    coord cluster
1    1 -2.257141 -0.4784238 5.323576       1
2    2 -2.074013  0.6718827 4.752956       1
3    3 -2.356335  0.3407664 5.668437       1
4    4 -2.291707  0.5953999 5.606421       1
5    5 -2.381863 -0.6446757 6.088877       1
6    6 -2.068701 -1.4842053 6.482388       1

集群也以dbscan的形式存储在$clusters对象下。因此，您可以这样做：

dat$cluster = viz$data$cluster

或：

dat$cluster = clus$cluster
cluster-analysisdbscanrr