我在3个不同的时间点收集了7个不同的病毒浓度数据点如何用R中的误差线对此进行图形显示？

问题描述

我收集了七个不同浓度的昆金病毒样品。

3个样本来自24小时时间点：667、1330、1670
两个采样来自48小时时间点：323000、590000
在72小时的时间点中有2个样本：3430000、4670000

如何创建一个点图来反映此数据，包括R中的误差线？我正在使用ggplot2。

到目前为止，我的代码是：

data1 <-data.frame(hours,titer)
ggplot(data1,aes(x=hours,y=titer,colour = hours)) + geom_point()

解决方法

我建议您使用下一种方法。如果需要误差线，则可以基于均值和标准差进行计算。在下一个代码中，草绘了执行此操作的方法。我使用了一个标准偏差，但您可以设置其他任何值。同样，您想查看其他示例时，我使用了facet_wrap()。这里的代码：

library(ggplot2)
library(dplyr)
#Data
df <- data.frame(sample=c(rep('24 hour',3),rep('48 hour',2),rep('72 hour',2)),titer=c(667,1330,1670,323000,590000,3430000,4670000),stringsAsFactors = F)
#Compute error bars
df <- df %>% group_by(sample) %>% mutate(Mean=mean(titer),SD=sd(titer))
#Plot
ggplot(df,aes(x=sample,y=titer,color=sample,group=sample))+
  geom_errorbar(aes(ymin=Mean-SD,ymax=Mean+SD),color='black')+
  geom_point()+
  scale_y_continuous(labels = scales::comma)+
  facet_wrap(.~sample,scales='free')

输出：

如果您有通用的y轴比例尺，则可以尝试以下方法：

#Plot 2
ggplot(df,scales = 'free_x')

输出：

ggplot2 graphing r r