问题描述
我正在为随机森林在R中绘制一些部分依赖图。我正在使用pdp软件包，它对z变量的限制没有任何反应。 代码：
pd <- partial(RF,pred.var= c ( "SOC","Q"))
plotPartial(pd,zlim=c(1000,3000))
我也尝试过： zlim（c（1000,3000），zmax，min和类似物
解决方法
谢谢您的建议，这是我的代码
library(randomForest) #fitting RF
library(pdp) #partial dependence analysis
set.seed(100)
RF=randomForest(CorrYield~Year+SOC+pH+ Sorghum+Pbray + FertP+ FertN+ PP_veg +PP_PC,data= RF_sin1,ntree=500,importance=T,proximity=T)
pd_SOC_P <- partial(RF,pred.var= c("SOC","Pbray"))
plotPartial(pd_SOC_P,xlab="SOC(%)",ylab="PBray(mg kg^-1)")