在Fasta文件中使用AWK之前,请删除模式和所有内容

问题描述

我进行了很多搜索,但找不到解决我问题的方法。我有一个看起来像这样的文件:

>HEADER1
AACTGGTTACGTGGTTCTCT
>HEADER2
GGTTTCTC
>HEADER3
CCAGGTTTCGAGGGGTTACGGGGTA

我想删除GGTT模式及其之前的所有内容。因此,基本上,某些行中有几种模式,因此我想删除所有模式,包括模式之前或之中的所有内容。

所需的输出应如下所示:

>HEADER1
CTCT
>HEADER2
TCTC
>HEADER3
ACGGGGTA

我尝试建议ways,但无法将其调整为我的数据。

在此先感谢您的帮助。

解决方法

暂无找到可以解决该程序问题的有效方法,小编努力寻找整理中!

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