使用RDkit计算描述符

问题描述

我正在尝试使用python中的RDkit计算分子列表的所有描述符（均为2D / 3D）。当我跑步时：

MolecularDescriptorCalculator.CalcDescriptors（mol，simplelist）

它返回：

AttributeError：“ Mol”对象没有属性“ simpleList”

解决方法

看起来您使用的API有点错误，您需要首先使用所需的描述符列表初始化MolecularDescriptorCalculator类。

simplelist = ['TPSA']  # In the list add the names of the descriptors required
calculator = MolecularDescriptorCalculator(simplelist)
descriptors = calculator.CalcDescriptors(mol)
print(descriptors)

[Out]:
(21.259999999999998,)