提交队列时，CPU数量不足

问题描述

我正在尝试将使用120个进程的作业提交到队列系统。在此群集中，每个节点有40个CPU，因此我要请求3个节点，每个节点上有40个进程。我的PBS脚本如下：

#!/bin/bash

#PBS -N phosphorene
#PBS -l nodes=3:ppn=40
#PBS -m abe
#PBS -q comm_small_day

NP=$(wc -l $PBS_NODEFILE | awk '{print $1}')
echo "Total CPU count = $NP"            

mpiexec gpaw python phosphorene.py

第一两行（在PBS命令之后）告诉我有多少个CPU。这些行的输出是

Total CPU count = 120

应有的。但是，gpaw-python任务仅在40个CPU上运行。

我什至尝试运行任务

mpiexec -n 120 gpaw python phosphorene.py

但是它告诉我没有足够的插槽。我正在使用openmpi版本3.1.4。

我不知道该怎么办。感谢您的帮助。

解决方法

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